Mutasjoner er tilfeldige endringer i DNA. De fleste mutasjoner er enten skadelige eller nøytrale. Selv når mutasjoner fører til tilpasning, innebærer dette vanligvis tap eller endring av eksisterende funksjon, ikke utvikling av helt nye biologiske strukturer.

Naturlig seleksjon kan sortere og favorisere eksisterende variasjon, men den kan ikke forklare opprinnelsen til ny genetisk informasjon. Dermed kan mutasjoner og seleksjon forklare variasjon innen eksisterende livsformer, men ikke opprinnelsen til kompleksitet, nye organer eller nye biologiske systemer.